A különbség a bázis excision javítás és a nukleotid excision javítás között | BER vs NER
Key Difference - Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair
a különböző belső és külső tényezők miatti károkért. Azonban a sejtes javító rendszerek azonnal és folyamatosan korrigálják a károkat, mielőtt mutációvá válnának, vagy mielőtt átadnának a következő generációknak. A sejtekben háromféle kivágási javító rendszer létezik: nukleotid excision repair (NER), bázikus kivágás javítás (BER) és DNS mismatch repair (MMR) az egyszálú DNS-károsodások kijavítására. A legfontosabb különbség a bázikus kivágás javítása és a nukleotid kivágás javítása között az, hogy bázikus kivágás javítás egy egyszerű javító rendszer, amely a sejtekben javítja az egyedi nukleotid károsodásokat, amelyek endogén módon , míg a nukleotid excíziós javítás komplex javítás rendszer, amely a sejtekben dolgozik, hogy viszonylag nagyobb, sérült területeket kijavítson exogén módon.
Tartalomjegyzék
1. Áttekintés és kulcskülönbség
2. Mi az alaptömörítési javítás
3. Mi a nukleotid kiváltás javítása
4. Side by Side Összehasonlítás - Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair
5. Összefoglaló
Mi az a Base Excision Repair?
A bázis excíziós javítás a DNS-javító rendszer legegyszerűbb verziója. Kisebb sérülések kijavítására használják a DNS-ben. A DNS-bázisok a deaminálás vagy az alkilezés következtében módosulnak. Bázis károsodások esetén a DNS glikoziláz felismeri és aktiválja az alap excíziós javító rendszert, és enzimekkel, AP endonukleázzal, DNS-polimerázzal és DNS-ligázzal segítik elő. A következő lépések a BER rendszerben vannak.
- Egy DNS-glikoziláz helytelen vagy sérült bázisának felismerése és eltávolítása egy abaszikus hely létrehozásához (alapveszteség-kapurinsav vagy apirimidin helyek helye).
- Apasiens / apirimidin endonukleázzal végzett abasikus helyszíni metszés
- A fennmaradó cukorfragmentum eltávolítása lyázzal vagy foszfodiészterázzal
- DNS-polimeráz
! --3 ->
01. ábra: Alap excíziós javítási útvonal
Mi a Nucleotide Excision Repair?
A nucleotide excision repair (NER) fontos DNS-kivágási rendszer a sejtekben. Meg tudja javítani és kicserélni a sérült területeket 30 bázis hosszúságig, és a sértetlen sablonszál irányítja.Az UV sugárzás következtében általános DNS-károsodások következnek be, és a NER védi a DNS-t a károsodások azonnali kijavítása előtt, mielőtt mutációvá válna, átjutna a jövő generációira vagy betegségeket okozna. A NER kifejezetten védelmet nyújt az olyan külső tényezők által okozott mutációk ellen, mint a környezeti és kémiai rákkeltők. A NER szinte minden szervezetben látható, és felismeri azokat a károkat, amelyek jelentős torzulást okoznak a DNS-hélixben.
A NER folyamat számos fehérje, például XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB stb. Hatását foglalja magában, és számos vágási és paszta mechanizmussal folytatódik. Ezek a fehérjék elengedhetetlenek a javítási folyamat befejezéséhez, és az egyik NER fehérje egyik hibája létfontosságú, és ritka recesszív szindrómákat okozhat: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne-szindróma (CS) és a törékeny hajszál betegségének fényérzékeny formája trichothiodystrophia (TTD).
02. ábra: Nucleotide Excision Repair
Mi a különbség a Base Excision Repair és a Nucleotide Excision Repair között?
- diff Artikel Közel a táblázat előtt -> |
|
| Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair | A Base Excision Repair (BER) egy DNS-javító rendszer a sejtekben. |
| A nukleotid excision repair (NER) egy másik típusú DNS-javító rendszer, amelyet a sejtekben találtunk. | |
| A DNS-adductek felismerése | A BER kijavítja a kis DNS adductumokat. |
| NER javítás nagy DNS adduktumok. | |
| DNS Damages | A BER felismeri azokat a károkat, amelyek nem okoznak jelentős torzulást a DNS-hélixhez. |
| A NER elismeri azokat a károkat, amelyek jelentős torzulást okoznak a DNS-hélixben. | |
| A DNS-károk okai | A BER javítja az endogén mutagének által okozott károkat. |
| A NER javítja az exogén mutagének által okozott károkat. | |
| Komplexitás | A BER a legkisebb bonyolult javítórendszer |
| Bonyolultabb, mint a BER. | |
| Szükséges fehérjék | A BER nem igényel más fehérjéket. |
| A NER több génterméket, különösen fehérjéket igényel, hogy megkülönböztesse a sérült és sértetlen régiókat. | |
| Alkalmasság | A BER alkalmas egybázisú károk kijavítására. |
A NER alkalmas a sérült régiók cseréjére.
Összegzés - Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair
A NER és a BER a sejtekben talált DNS-kivágási eljárások kétféle típusa. A BER képes kijavítani az endogén módon okozott károsodásokat, miközben a NER képes kijavítani a 30 bázispár hosszúságú károkat leginkább exogén módon. A BER különbözik a NER-től a felismert szubsztrátumokban és a kezdeti hasítási eseményben. A BER felismeri azokat a károkat is, amelyeket nem a DNS-hélix jelentős torzulása okozott, míg a NER a DNS-hélix jelentős torzulásait felismeri. Ez a különbség a bázis excíziós javítás és a nukleotid kivágás között.
Kép jóvoltából:
1. "Dna repair base excersion en" A LadyofHats - (Public Domain) Commons Wikimedia alatt
2. "Az Uvr fehérjék által ellenőrzött nukleotid excíziós javítási útvonal modelljeinek sematikus ábrázolása" Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui és Seiki Kuramitsu - CC BY 1.0) Commons Wikimedia alatt
Referenciák:
1. Kim, Yun-Jeong és David M. Wilson. "A Base Excision Repair Biochemistry áttekintése. "Jelenlegi molekuláris farmakológia. U. S. National Library of Medicine, 2012. január. 2017. március 14.
2. Boer, Jan De és Jan H. J. Hoeijmakers. "Nucleotide excision repair és humán szindrómák. "Karcinogenezis. Oxford University Press, 2000. március 01. Web. 28 Március 2017
3. Hoogstraten et al. "Sokoldalú DNS károsodás kimutatása a globális genom nukleotid excíziós javító protein XPC-vel. "Journal of Cell Science. A Biológusok Társasága Kft., 2008. szeptember 01. Web. 28 Március 2017
