Különbség VNTR és STR között | VNTR vs STR
Kulcs különbség - VNTR vs STR
A DNS-vizsgálatok hatalmas hasznot hoznak a filogenetikai kapcsolatok megértésében és meghatározásában, genetikai betegségek diagnosztizálásában és a szervezet genomjainak feltérképezésében. A DNS-analízissel kapcsolatos számos technikát alkalmaznak egy adott gén vagy DNS-szekvencia azonosítására egy ismeretlen DNS-gyűjteményben. Genetikai markerekként ismertek. A molekuláris biológiában genetikai markereket alkalmaznak az egyének és a fajok genetikai változatainak azonosítására. A változó számú tandem ismétlés (VNTR) és a rövid tandem ismétlés (STR) kétféle genetikai markert mutatnak, amelyek polimorfizmust mutatnak az egyének között. Mindkét típus nem kódoló ismétlődő DNS, amely tandem ismétlés. A kromoszómákban fej és farok divatja van. A VNTR a genom egy része, ahol a rövid nukleotidszekvenciát többször megismétlik. STR a DNS egy másik része a genomon belül, amelyet ismétlődő egységekként szerveznek, amelyek két-tizenhárom nukleotidot tartalmaznak százszor. A VNTR és STR közötti különbség a nukleotidok száma egy ismétlődő szekvenciában. A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll, míg az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotid . A VNTR és az STR széles körben használatos kriminalisztikai vizsgálatokban.
Tartalomjegyzék
1. Áttekintés és kulcskülönbség
2. Mi a VNTR
3. Mi az STR
4. Hasonlóságok a VNTR és STR
között 5. Oldalankénti összehasonlítás - VNTR vs STR tabuláris alakban
6. Összefoglaló
Mi a VNTR?
A tandem ismétlés a DNS rövid szekvenciája, amelyet egy adott kromoszómális lókuszban a faroknál daganattal ismételnek meg. A tandem ismétlésen belül nincs más szekvencia vagy nukleotid. A genomban többféle tandem ismétlés van. A VNTR egy tandem ismétlési típus, amely ismétlődő egységekből áll, 10 és 100 nukleotid között. A VNTR egyfajta miniszatellit. Ezek a tandem ismétlések sok kromoszómában találhatók. A humán genomon belül vannak, és elsősorban a kromoszómák szubtelomer régióiban helyezkednek el.
A VNTR-ek tandem ismétlődő polimorfizmust mutatnak az egyének között. A VNTR hossza a kromoszóma egy adott helyén igen nagy mértékben változik az egyének között az adott DNS szakaszban szervezett ismétlődő egységek számának változása miatt. Ezért a VNTR-t hatékony eszközként lehet használni az egyének azonosításában, és a VNTR elemzést számos területen használják, beleértve a genetikát, a biológiai kutatásokat, a kriminalisztika és a DNS-ujjlenyomatot.A VNTR-ek voltak az első genetikai markerek, amelyeket a csontvelő-transzplantáció számszerősítésére használták fel. A VNTR-ek az első olyan polimorf markerek is voltak, amelyeket a kriminalisztika területén a DNS-profilozásban alkalmaztak.
->01. ábra: A VNTR-ek változása hat egyénben
A VNTR analízist restrikciós fragmentum hosszúságú polimorfizmussal végezzük, amelyet a déli hibridizáció követi. Ezért viszonylag nagy DNS-mintavételre van szüksége. A VNTR profil értelmezése szintén problémás. E korlátozások miatt a VNTR krónikus genetikában való alkalmazása korlátozott, és helyébe STR elemzés lépett.
Mi az STR?
STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, amelyeket tandem módon szervezünk. A STR hasonló a VNTR-hez. De a VNTR-től a nukleotidok számától függően ismétlődő szekvenciában és az ismétlések számában változik. STR egyfajta mikroszatellit.
STR-analízis az ismétlődő egységek pontos számának mérésében. Az STR-k nagyon változatosak az egyének körében, hasonlóan a VNT-khez. A STR profilok személyenként különböznek. Ezért a molekuláris biológiában STR analízist alkalmaznak a specifikus lokuszok két vagy több mintából történő DNS-összehasonlítására. Ezért az STR-ket erőteljes genetikai markereknek tekintik a molekuláris biológiában. Kiváló eszköz az egyedek azonosítására, mivel magas polimorfizmust és viszonylag rövid ideig tartanak.
Jelenleg az STR-ek a leggyakrabban használt elemzett genetikai polimorfizmus eszközei a törvényszéki genetikában. A legtöbb igazságügyi ügyben STR polimorf elemzést alkalmaznak. A STR lokák a genomban terjednek. A kromoszómákban több ezer olyan STR található, amely igazságügyi elemzésre használható. A STR analízis nem tartalmaz korlátozási hossza polimorfizmust, például a VNTR analízist. A STR analízis nem korlátozza a DNS-t restrikciós enzimekkel. Speciális próbákat alkalmazunk a kívánt régiók DNS-hez való csatolására és PCR-technikát alkalmazva, meghatározzuk az STR hosszúságait.
02. ábra: STR variációk a minták között
Mi a VNTR és STR közötti hasonlóság?
- A VNTR és STR nem kódoló DNS.
- Mindkettő tandem ismétlés.
- Mindkettő polimorfizmust mutat az egyének között a DNS szakasz hosszának különbsége miatt.
- Mindkettőt erőteljes genetikai markerekként használják a DNS-ujjlenyomatokban és az igazságügyi vizsgálatokban.
Mi a különbség a VNTR és az STR között?
- diff Artikkel Közel a táblázat előtt ->
VNTR vs STR |
|
A VNTR nem kódoló ismétlődő DNS, amelynek rövid nukleotidszekvenciája ismételten megismétlődik. | STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, amelyeket tandem módon szervezünk. |
Méret | |
A VNTR-ek nagyobbak, mint az STR-ek. | Az STR-k kisebbek, mint a VNTR-ek. |
Nukleotidok száma ismétlődő szekvenciában | |
A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll. | Az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotidot tartalmaz. |
Összegzés - VNTR vs STR
A VNTR és STR a molekuláris biológiában használt két erős genetikai markert, különösen a törvényszéki genetika területén.A VNTR a miniszatellit egyik típusa, az STR egy mikroszatellit. A VNTR és STR nem kódoló, rendkívül ismétlődő DNS. Tandem ismétlés. A VNTR és az STR általános szerkezete azonos. Azonban a nukleotidok száma az ismétlődő szekvenciában és a hossza eltérő. A VNTR ismétlődő szekvenciái 10-100 nukleotidból állnak. STR-nek 2-13 nukleotidból álló ismétlődő szekvenciái vannak. Ez a különbség a VNTR és az STR között.
A VNTR vs STR PDF verziójának letöltése A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra használhatja az idézeti jegyzetek szerint. Kérjük, töltse le a PDF verziót itt a különbség a VNTR és az STR között.
Referenciák:
1. "A Forensic Genetics tudománya. "CRG - Felelős Genetika Tanácsa. N. p., n. d. Web. Elérhető itt. 2017. július 10.
2. "STR analízis. "Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2017. március 22. Web. Elérhető itt. 2017. július 10.
Kép kedvesség: