Különbség VNTR és STR között | VNTR vs STR

Anonim

Kulcs különbség - VNTR vs STR

A DNS-vizsgálatok hatalmas hasznot hoznak a filogenetikai kapcsolatok megértésében és meghatározásában, genetikai betegségek diagnosztizálásában és a szervezet genomjainak feltérképezésében. A DNS-analízissel kapcsolatos számos technikát alkalmaznak egy adott gén vagy DNS-szekvencia azonosítására egy ismeretlen DNS-gyűjteményben. Genetikai markerekként ismertek. A molekuláris biológiában genetikai markereket alkalmaznak az egyének és a fajok genetikai változatainak azonosítására. A változó számú tandem ismétlés (VNTR) és a rövid tandem ismétlés (STR) kétféle genetikai markert mutatnak, amelyek polimorfizmust mutatnak az egyének között. Mindkét típus nem kódoló ismétlődő DNS, amely tandem ismétlés. A kromoszómákban fej és farok divatja van. A VNTR a genom egy része, ahol a rövid nukleotidszekvenciát többször megismétlik. STR a DNS egy másik része a genomon belül, amelyet ismétlődő egységekként szerveznek, amelyek két-tizenhárom nukleotidot tartalmaznak százszor. A VNTR és STR közötti különbség a nukleotidok száma egy ismétlődő szekvenciában. A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll, míg az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotid . A VNTR és az STR széles körben használatos kriminalisztikai vizsgálatokban.

Tartalomjegyzék

1. Áttekintés és kulcskülönbség

2. Mi a VNTR

3. Mi az STR

4. Hasonlóságok a VNTR és STR

között 5. Oldalankénti összehasonlítás - VNTR vs STR tabuláris alakban

6. Összefoglaló

Mi a VNTR?

A tandem ismétlés a DNS rövid szekvenciája, amelyet egy adott kromoszómális lókuszban a faroknál daganattal ismételnek meg. A tandem ismétlésen belül nincs más szekvencia vagy nukleotid. A genomban többféle tandem ismétlés van. A VNTR egy tandem ismétlési típus, amely ismétlődő egységekből áll, 10 és 100 nukleotid között. A VNTR egyfajta miniszatellit. Ezek a tandem ismétlések sok kromoszómában találhatók. A humán genomon belül vannak, és elsősorban a kromoszómák szubtelomer régióiban helyezkednek el.

A VNTR-ek tandem ismétlődő polimorfizmust mutatnak az egyének között. A VNTR hossza a kromoszóma egy adott helyén igen nagy mértékben változik az egyének között az adott DNS szakaszban szervezett ismétlődő egységek számának változása miatt. Ezért a VNTR-t hatékony eszközként lehet használni az egyének azonosításában, és a VNTR elemzést számos területen használják, beleértve a genetikát, a biológiai kutatásokat, a kriminalisztika és a DNS-ujjlenyomatot.A VNTR-ek voltak az első genetikai markerek, amelyeket a csontvelő-transzplantáció számszerősítésére használták fel. A VNTR-ek az első olyan polimorf markerek is voltak, amelyeket a kriminalisztika területén a DNS-profilozásban alkalmaztak.

->

01. ábra: A VNTR-ek változása hat egyénben

A VNTR analízist restrikciós fragmentum hosszúságú polimorfizmussal végezzük, amelyet a déli hibridizáció követi. Ezért viszonylag nagy DNS-mintavételre van szüksége. A VNTR profil értelmezése szintén problémás. E korlátozások miatt a VNTR krónikus genetikában való alkalmazása korlátozott, és helyébe STR elemzés lépett.

Mi az STR?

STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, amelyeket tandem módon szervezünk. A STR hasonló a VNTR-hez. De a VNTR-től a nukleotidok számától függően ismétlődő szekvenciában és az ismétlések számában változik. STR egyfajta mikroszatellit.

STR-analízis az ismétlődő egységek pontos számának mérésében. Az STR-k nagyon változatosak az egyének körében, hasonlóan a VNT-khez. A STR profilok személyenként különböznek. Ezért a molekuláris biológiában STR analízist alkalmaznak a specifikus lokuszok két vagy több mintából történő DNS-összehasonlítására. Ezért az STR-ket erőteljes genetikai markereknek tekintik a molekuláris biológiában. Kiváló eszköz az egyedek azonosítására, mivel magas polimorfizmust és viszonylag rövid ideig tartanak.

Jelenleg az STR-ek a leggyakrabban használt elemzett genetikai polimorfizmus eszközei a törvényszéki genetikában. A legtöbb igazságügyi ügyben STR polimorf elemzést alkalmaznak. A STR lokák a genomban terjednek. A kromoszómákban több ezer olyan STR található, amely igazságügyi elemzésre használható. A STR analízis nem tartalmaz korlátozási hossza polimorfizmust, például a VNTR analízist. A STR analízis nem korlátozza a DNS-t restrikciós enzimekkel. Speciális próbákat alkalmazunk a kívánt régiók DNS-hez való csatolására és PCR-technikát alkalmazva, meghatározzuk az STR hosszúságait.

02. ábra: STR variációk a minták között

Mi a VNTR és STR közötti hasonlóság?

  • A VNTR és STR nem kódoló DNS.
  • Mindkettő tandem ismétlés.
  • Mindkettő polimorfizmust mutat az egyének között a DNS szakasz hosszának különbsége miatt.
  • Mindkettőt erőteljes genetikai markerekként használják a DNS-ujjlenyomatokban és az igazságügyi vizsgálatokban.

Mi a különbség a VNTR és az STR között?

- diff Artikkel Közel a táblázat előtt ->

VNTR vs STR

A VNTR nem kódoló ismétlődő DNS, amelynek rövid nukleotidszekvenciája ismételten megismétlődik. STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, amelyeket tandem módon szervezünk.
Méret
A VNTR-ek nagyobbak, mint az STR-ek. Az STR-k kisebbek, mint a VNTR-ek.
Nukleotidok száma ismétlődő szekvenciában
A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll. Az STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotidot tartalmaz.

Összegzés - VNTR vs STR

A VNTR és STR a molekuláris biológiában használt két erős genetikai markert, különösen a törvényszéki genetika területén.A VNTR a miniszatellit egyik típusa, az STR egy mikroszatellit. A VNTR és STR nem kódoló, rendkívül ismétlődő DNS. Tandem ismétlés. A VNTR és az STR általános szerkezete azonos. Azonban a nukleotidok száma az ismétlődő szekvenciában és a hossza eltérő. A VNTR ismétlődő szekvenciái 10-100 nukleotidból állnak. STR-nek 2-13 nukleotidból álló ismétlődő szekvenciái vannak. Ez a különbség a VNTR és az STR között.

A VNTR vs STR PDF verziójának letöltése A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra használhatja az idézeti jegyzetek szerint. Kérjük, töltse le a PDF verziót itt a különbség a VNTR és az STR között.

Referenciák:

1. "A Forensic Genetics tudománya. "CRG - Felelős Genetika Tanácsa. N. p., n. d. Web. Elérhető itt. 2017. július 10.

2. "STR analízis. "Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2017. március 22. Web. Elérhető itt. 2017. július 10.

Kép kedvesség:

1. "D1S80Demo" A PaleWhaleGail az angol Wikipédián (CC BY-SA 3. 0) a Commons Wikimedia alatt