Különbség Exome és Transcriptome között | Exome vs Transcriptome

Kulcs különbség - Exome vs. Transcriptome

A gén kódolási és nem kódoló régiókat tartalmaz. A kódoló szekvenciák exonként ismertek, és a nem kódoló szekvenciák intronokként ismertek. A gén exonjainak nukleotidszekvenciája a gén genetikai kódját jelenti a specifikus fehérje szintéziséhez. Ezért az exonok az mRNS molekulában maradnak. A genom teljes exon régiója exome néven ismert, és ez a genom fontos része. A gének genetikai kódját átalakítják az mRNS molekula genetikai kódjává, amely a fehérje előállításához szükséges. A sejtekben vagy sejtpopulációban egy időben átírt mRNS-molekulák transzkriptómént ismertek. Az exome és a transzkriptóm között a legfontosabb különbség az, hogy

exome a genom exon régióinak szekvenciáit jelenti, míg a transzkriptom egy adott sejt vagy szövet összes mRNS-ét jelenti egy adott időpontban.

Tartalomjegyzék

1. Áttekintés és kulcskülönbség

2. Mi az Exome

3. Mi a Transcriptome

4. Oldalankénti összehasonlítás - Exome vs Transcriptome

5. Összefoglaló

Mi az Exome?

A gének exonokból, intronokból és szabályozó szekvenciákból állnak. Az exonok azok a génrégiók, amelyek transzkripció során mRNS szekvenciára transzkripálódnak. Intronok és más nem kódoló régiók eltávolítása a transzkripció során. Az exonok nukleotidszekvenciája meghatározza azon gén genetikai kódját, amely szintetizálja az általa kódolt specifikus fehérjét. Csak exon marad a protein mRNS-ében. Az exonok gyűjtése a genomban egy szervezet exomájaként ismert. Ez a genom egy része, amely génekben expresszálódik. Emberben az exome 1% -ot a genomból. Ez az emberi genom fehérje kódoló része.

01. ábra: Exome

Mi a Transcriptome?

A transzkriptom az összes fehérje kódoló és nem kódoló transzkriptum (RNS) gyűjteménye egy adott szövetben. A transzkriptom a sejtekben vagy szövetekben lévő gének által expresszált összes mRNS molekulák összegyűjtését jelenti. Egy sejt transzkriptómája más típusú sejtek transzkripto-jával változtatható. A transzkriptóm is dinamikus - idővel változik mind a belső, mind a külső ingerekre válaszul. Még ugyanabban a szövetben vagy ugyanazon sejttípuson belül, a transzkripció néhány perc elteltével megváltozhat.

A transzkriptom különbözik a szervezet exomájától. A transzkriptóm csak az expresszált exome-szekvenciákat tartalmazza.Bár a sejt exómája változatlan marad, a transzkriptómák különböznek a sejtek között, mivel a génexpresszió nem minden sejt vagy szövet esetén azonos. Csak az esszenciális gének expresszálódnak különböző sejtekben és szövetekben. A génkifejezés szövet vagy sejt típusú specifikus folyamat. Ezt számos tényező szabályozza, beleértve a környezeti tényezőket. Ezért a transzkriptóm változhat a külső környezeti feltételek mellett.

A transzkriptonot a proteomikai vizsgálatok előfutára használják. Valamennyi fehérje mRNS szekvenciából származik. A transzláció módosításai a fehérjék változásait eredményezhetik. Azonban a transzkripton fontos alapinformációt nyújt a proteomikai vizsgálatokhoz.

02. ábra: Az embrionális őssejtek transzkriptómája

Mi a különbség az Exome és a Transcriptome között?

- diff Artikkel Közel a táblázat előtt ->

Exome vs Transcriptome

Exome a gének fehérje kódoló régiójának gyűjteménye.
A transzcriptom minden átíródott RNS, beleértve az mRNS-et.	Minta
Az Exome-t DNS-minta segítségével vizsgáljuk.
A transzkriptomot RNS-minta segítségével vizsgáljuk.	Tanulmányi módszer
Az egész exome-szekvenálás az exome tanulmányozása.
Az RNS-szekvenálás a transzkriptómák tanulmányozásának módja.	Összefoglaló - Exome vs Transcriptome

Az exonok a gének kódoló szekvenciái és meghatározzák a fehérjék mRNS-szekvenciáit. A kódoló szekvenciák (exonok) gyűjteménye egy szervezet exome-ként ismert. A géneket mRNS-molekulákká írták át fehérje előállítása előtt. A sejtek vagy szövetek teljes mRNS-molekulái bármelyik időpontban transzkriptómént ismertek. A transzkripto-mák azok a gének, amelyek bármelyik időpontban aktívan mRNS-be expresszálódnak. A transzkriptóma sejt- és szövetspecifikus, és hatással van a környezeti feltételekre. Ez a különbség az exome és a transzkriptóm között.

Referenciák:

1. Sarah és munkatársai, "Célzott felvétel és tizenkét emberi fogyasztás tömegesen párhuzamos szekvenálása. " Természet. U.S. Orvostudományi Könyvtár, 2009. szeptember 10. Web. 2017. április 01.

2. Mutz et al. "Transzkriptoanalízis a következő generációs szekvenálással. "Elsevier: cikkkeresõ. N. p., 2012. szeptember. Web. 01 Apr. 2017

Kép kedvesség:

1. "Pluripotens sejtek transzkriptómája" Grskovic, M. és Ramalho-Santos, M., A pluripotens transzkriptóm (2008. október 10.), StemBook, szerk. Az őssejtkutatási közösség, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook 2. ábra A pluripotens sejtek transzkripciója. Grskovic, M. és Ramalho-Santos, M., A pluripotens transzkriptóm (2008. október 10.), StemBook, szerk. Az őssejtkutatási közösség, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) Commons Wikimedia alatt