Különbség az siRNS és az shRNS között | shRNA vs siRNA

shRNA vs siRNA

(RNSi), a célgén expresszióját magas specifitással és szelektivitással leüti. Az RNSi természetes folyamat, amely kis interferáló RNS-t (siRNS) és rövid hajtű RNS-t (shRNA) és kétfunkciós shRNS-t tartalmaz. Jelenleg az RNS-t széles körben alkalmazzák a személyre szabott rákterápia eszközeként. Az RNSi alkalmazását alapvetően a kémiailag szintetizált kétszálú siRNS és vektor alapú shRNS molekulákkal végezzük. Bár ez a két molekula hasonló funkcionális kimenetelű, szerkezetükben különbözik; így a molekuláris hatásmechanizmusok, az RNS-útvonalak és a két molekula nem célzott hatásai is különböznek egymástól.

->

shRNA

Az shRNA egy kis RNS molekula szekvenciája, amely szűk hajtű fordulatot eredményez, amely felhasználható a célgén expressziójának RNAi során történő elhallgattatására. Az shRNS expresszióját vektorral lehet elérni, amely lehet vírus vagy baktérium vagy plazmidok bejuttatása. A sejtek sejtmagjában szintetizálódnak, és a további folyamatokhoz továbbítják a citoplazmába. Ezeknek a molekuláknak a miRNS hasonló érési útvonalai vannak; így a miRNS szintézise megalapozta az shRNS szintézis megértését. Az RNS polimeráz II vagy III RNS polimeráz II vagy III promotereken keresztül átírhatja az shRNS-t. Az shRNS használatának előnye, hogy viszonylag alacsony a bomlás és a forgalom. A hátrány az, hogy olyan expressziós vektorra van szüksége, amely bizonyos biztonsági kérdéseket okozhat.

siRNA

Az siRNS kétszálú RNS molekula, amely 20-25 bázispár hosszúságú. Ezeket a gén elnyomására használják, ha az RNSi útvonalon komplementer nukleotidszekvenciával rendelkező gént elcsendesítenek. A siRNS transzfekciójával végzett génhiány gyakran sikertelen a tranziens hatás miatt; különösen a gyorsan osztódó sejtekben, és a szuppresszió nem tart tovább. A probléma leküzdésére az siRNS-t módosították egy rövid hajtűstruktúra bevezetésével. Ez a módosított molekula, az úgynevezett shRNS. Az SHRNA-t át kell alakítani egy sirálynak a siRNS-be annak érdekében, hogy normális funkcióját meg tudja valósítani.

Mi a különbség az shRNA és a siRNA között?

• Az siRNS-től eltérően az shRNA extra hajtűs szerkezettel rendelkezik. Az shRNA a siRNA módosított változata.

• Az shRNS-hez expressziós vektor szükséges, míg az siRNA nem.

• Az shRNS használható hosszú távú leütéshez, míg az siRNA csak a gének rövid távú kimerüléséhez használható.

• Az siRNS génelnyelésével ellentétben az shRNS szuppressziója tartós, és ha megfelelő vírusvektorral van beiktatva, akkor állandó génelhárító hatásokat eredményezhet.

• A Dicer-nek szüksége van arra, hogy az shRNS-t visszaadja siRNA molekulának a normál funkcióinak végrehajtása érdekében.