Különbség AFLP és RFLP között | AFLP vs RFLP

Kulcsfontosságú különbség - AFLP vs RFLP

A DNS-vizsgálatok hatalmas szerepet játszanak a filogenetikai kapcsolatok megértésében és meghatározásában, genetikai betegségek diagnosztizálásában és a szervezet genomjainak feltérképezésében. A DNS-analízishez kapcsolódó számos technikát alkalmaznak egy adott gén vagy DNS-szekvencia azonosítására egy ismeretlen DNS-gyűjteményben. Molekuláris markerekként ismertek. amplifikált fragmentum hossz polimorfizmus (AFLP) és a restrikciós fragmentum hossz polimorfizmus (RFLP) két ilyen molekuláris markerek (módszerek) kifejlesztett molekuláris biológiai kimutatására közötti genetikai variáció organizmusok. Mindkét módszer ugyanilyen fontos, és előnyei és hátrányai vannak. Az AFLP és az RFLP közötti különbség az, hogy AFLP magában foglalja az emésztett DNS szelektív PCR-amplifikációját, míg az RFLP nem jár a DNS-fragmensek szelektív PCR-amplifikációjával.

Tartalomjegyzék

1. Áttekintés és kulcskülönbség

2. Mi az AFLP

3. Mi az RFLP

4. Side by Side Összehasonlítás - AFLP vs RFLP

5. Összefoglaló

Mi az AFLP?

Az AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) fontos molekuláris biológiai eszköz, és széles körben használatos a genetikai variációs analízisben. Az AFLP a fragmentált genomi DNS specifikus PCR amplifikációján alapszik, és a polimorfizmus detektálása autoradiográfokon gélelektroforézissel történik. Az AFLP széles körben hozzájárul a genetikai különbségek azonosításához különböző törzsek vagy szorosan összefüggő fajok különböző államok, beleértve a növények, állatok, baktériumok és gombák. Az AFLP kis mennyiségű ismeretlen DNS-mintával végezhető. Nem igényel előzetes szekvencia ismereteket és a próbák tervezését.

lépései AFLP

1. DNS izolálása
2. emésztése a DNS restrikciós endonukleázokkal
3. ligálása a korlátozott DNS-fragmenseket adapterek
4. A szelektív amplifikációt a fragmentumok specifikus restrikciós oldalak
5. elválasztása a PCR-termékeket gélelektroforézissel
6. Megjelenítés a gél mátrix autoradiogram

AFLP egy érzékenyebb és reprodukálható módszert, amely felhasználható a DNS-profilok több taxon, ideértve a gombák, baktériumok, növények és állat a DNS-szekvenciák előzetes ismerete nélkül. Segít a lakosság körében az individuumban lévő kis különbségek azonosításában, amelyek rendkívül érzékenyek. Az AFLP szintén fontos a genomok feltérképezésében, törvényszéki vizsgálatokban, szülői tesztelésben, genotipizálásban, stb.

01. ábra: AFLP

Mi az RFLP?

A restrikciós fragmentum hossza A polimorfizmusok (RFLP-k) egy olyan technika, amelyet a homológ DNS-szekvenciák genetikai eltéréseinek detektálására használnak.Ez az első módszer a DNS profilalkotáshoz. A szervezeteknek egyedi DNS-ujjlenyomatuk vagy DNS-profiljuk van. Az RFLP fontos eszköz az intraspecifikus vagy szorosan kapcsolódó organizmusok DNS-profiljainak variábilis elemeinek elemzésére, mivel a homológ szekvenciák különböző restrikciós helyekkel (helyekkel) rendelkeznek, amelyek egy adott szervezetre jellemzőek. Ha a homológ DNS-t specifikus restrikciós endonukleázokkal emésztjük, akkor különböző DNS-profilokat eredményezünk, amelyek minden egyes egyedhez egyediek. Ezért ennek a módszernek a fő célja a genetikai változatok kimutatása a szervezetek között, a homológ DNS specifikus restrikciós enzimekkel történő korlátozásával és a fragmentum hosszúságú polimorfizmus gélelektroforézissel és blotolással történő analízisével. A blotting minták egyedülállóak az egyes organizmusokra és jellemzik az adott genotípusokat.

Az RFLP lépései

1. A DNS minta elegendő mennyiségének izolálása
2. A DNS-minták fragmensek specifikus restrikciós endonukleázokkal rövid szekvenciára
3. Az eredményül kapott fragmensek különféle hosszúságúak elválasztása agaróz gélelektroforézissel.
4. A gélprofil átvitele membránba Southern blotolással

5. A membrán hibridizálása jelölt próbákkal és a fragmentum hossza polimorfizmusának analízise minden profilban

Az RFLP egy nagyon fontos módszer a betegség öröklésének felderítésében és a a betegség előfordulásának kockázata a családtagok között. Az RFLP-t gyakran használják a genomok feltérképezésében, a bűnözők azonosításában a kriminalisztika, az apasági tesztelés stb. Terén. Az RFLP-nek számos korlátai is vannak. Az RFLP megköveteli a szekvenciaadatok előzetes ismeretét hibridizációs próbák készítéséhez. Azt is megköveteli, hogy elegendő mennyiségű DNS-t különítsen el a mintából az elemzéshez, ami igazságügyi vizsgálatokban nehéz.

01. ábra: RRFLP leképezés

Mi a különbség az AFLP és az RFLP között?

- diff Artikkel Közel a táblázat előtt ->

ALFP vs RFLP
Az AFLP magában foglalja az emésztett DNS szelektív PCR amplifikációját.	Az RFLP nem tartalmaz PCR-t, kivéve ha PCR-RFLP.
Sequence Knowledge
Korábbi szekvencia ismeretek nem szükségesek.	Előzetes szekvencia ismeretek szükségesek a tervezett RFLP próbákhoz.
Megbízhatóság
Ez megbízhatóbb.	Ez kevésbé megbízható az AFLP-hez képest.
A polimorfizmus kimutatásának hatékonysága
Ez nagyobb hatékonyságot mutat a polimorfizmus kimutatásában, mint az RFLP.	Ez kevésbé hatékony az AFLP-hez képest.
Költség
Ez egy kicsit drága az RFLP-hez képest.	Ez olcsóbb az AFLP-hez képest.
Alkalmazások
Az AFLP-ket alkalmazták a genomok feltérképezésére, a DNS-ujjlenyomat-készítésre, a genetikai sokféleségre vonatkozó vizsgálatokra, az apasági tesztelésre és a forensikára	Az RFLP-elemzés fontos eszköz a genomok feltérképezésében, a gének genetikai rendellenességek lokalizálásához, betegség és az apasági tesztelés.

Összefoglaló - AFLP és RFLP

Az AFLP és az RFLP két módszer, amelyeket genetikai markerekként használnak a sokféleség értékeléséhez és a molekuláris biológiai genetikai kapcsolatok értékeléséhez.Az AFLP hatékony és érzékeny módszer a genetikai polimorfizmus kimutatására a szervezetek között, mint az RFLP. Bár mindkét módszer különböző hatékonysággal rendelkezik a genetikai változatok kimutatásában, mégis használatosak DNS-ujjlenyomatvételre és betegségdiagnosztikára.

Referencia:

'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana L. Benchimol, Antônia M. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio L. és Anete P. De Souza. "A RAPD, RFLP, AFLP és SSR markerek összehasonlítása a trópusi kukorica beltenyésztett vonalak sokféleségével kapcsolatos vizsgálatokhoz. "Genetika és molekuláris biológia. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 március 2017

2. "Restrikciós töredék hossza polimorfizmus (RFLP). "Nemzeti Biotechnológiai Központ Információ. U. S. National Medicine Library, n. d. Web. 2017. március 19.

3. Masiga D. K. és Turner C. M. (2004). "Erősített (restrikciós) fragment hosszúság polimorfizmus (AFLP) analízis". Methods Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 Március 2017

Képtelenség:

1. "ALFP" Barbarossa a holland Wikipédiában - átvitt nl. wikipédia a Commons-hoz. (Public Domain) a Commons Wikimedia alatt

2. "RFLP mapping" A Retama - Saját munka (GFDL) a Commons Wikimedia alatt