Különbség a cDNS és a genomikai könyvtár között | cDNA vs genomikai DNS-könyvtár

Kulcs különbség - cDNS vs genomikus könyvtár A genetikai mérnököket alkalmazó tudósok két fő típusa van a DNS-könyvtáraknak. Ezek a cDNS könyvtár és a genomikus könyvtár. A cDNS és a genomikus könyvtár közötti

kulcs különbség , hogy cDNS könyvtár tartalmazza a szervezet összes mRNS klónozott komplementer DNS-ét, míg a genomiális DNS-könyvtár tartalmazza a szervezet teljes genomjának klónozott fragmenseit. A genomiális DNS-könyvtár nagyobb, mint a cDNS-könyvtár.

Tartalomjegyzék

1. Áttekintés és kulcskülönbség

2. Mi a cDNA könyvtár

3. Mi a Genomic Library

4. Side by Side összehasonlítás - cDNS vs genomikai könyvtár

5. Összefoglaló

Mi az a genomikus könyvtár?

A genomiális DNS-könyvtár olyan klónok gyűjteménye, amelyek egy szervezet teljes genomiális DNS-jének fragmentumát hordozzák. Tartalmazza a szervezet egész genomiális DNS-jét, beleértve a kódoló és nem kódoló szekvenciákat. A genomikus könyvtár felépítését a rekombináns DNS-technika végzi, amelyet klónozás követ (géntechnika). A konstrukcióban különböző lépések vannak, amint azt a 01. ábra mutatja. Az eljárás a genomi DNS-elkülönítéssel kezdődik. Megfelelő DNS-extrakciós protokoll alkalmazásával izolálni kell egy organizmus teljes genomiális DNS-ét. Ezután a DNS-t kezelhető méretűvé vagy specifikus fragmensekké alakítjuk restrikciós endonukleázokkal (DNS-enzimek). A fragmentált DNS-t vektorokba kell helyezni DNS-ligázokkal (DNS-csatlakozó enzimekkel). A vektor önreplikáló szervezet. A rekombináns DNS-technikában a plazmidok és bakteriofágok gyakran használt vektorok. Ezek a ligált vektorok rekombináns DNS-molekulákként ismertek, mivel mind saját, mind beillesztett DNS-szekvenciákat hordoznak. Rekombináns vektorokat adunk a gazda baktériumhoz, és a baktériumsejtben lévő rekombináns vektorokat felvesszük. A rekombináns vektorokkal (plazmidokkal) rendelkező baktériumokat táptalajon kell termeszteni. A bakteriális szaporodás során a bakteriális DNS, rekombináns plazmidokkal együtt, reprodukálja genomjaikat és klónokat termel. Ezek a klónok tartalmazzák a forrásszervezet teljes genomját. Ezért nevezik genomi könyvtárnak. A plazmidok könnyen elválaszthatók a bakteriális kromoszomális DNS-ből ahhoz, hogy létrehozzák a szervezet genomiális könyvtárát. Ha egy adott szervezet érdeklődő géneket tartalmaz, könnyen detektálható a genomiális könyvtárban hibridizációval molekuláris próbák (markerek) alkalmazásával.

A genomikus könyvtárak fontosak a genomiális struktúra és a funkciók, a specifikus gének, a gén elhelyezkedése, a gén-feltérképezés, a mutációk, a génszekvenálás, az új terápiás gének azonosítása stb. Tanulmányozása céljából.

Figure_1: genomi könyvtár

Mi a cDNS könyvtár?

A cDNS-könyvtár a komplement mRNS-ből szintetizált komplementer DNS (cDNS) klónok gyűjteménye. Az építési eljárás különböző lépéseket tartalmaz. Az első lépés a teljes mRNS tisztítása egy szervezetből. Az elkülönített mRNS-t cDNS-szálakká alakítjuk át fordított transzkripcióval. A fordított transzkripciót elősegíti egy reverz transzkriptáz nevű enzim. Egy kis 3 'primert használ, és elindítja a templát mRNS-szálhoz komplementer első cDNS-szál szintézisét. A kapott kettős szálú cDNS-t kisebb fragmensekká alakítjuk restrikciós endonukleázok alkalmazásával, és megfelelő vektorokká tesszük. Ezeket a konjugált rekombináns molekulákat ezután egy gazdaszervezetbe tesszük és tenyésztőközegben növesztjük klónok előállítására. A szervezet cDNS fragmenseit tartalmazó klónok gyűjtése cDNS könyvtárként ismert. A teljesen szeletelt érett mRNS nem tartalmaz intronokat és szabályozó régiókat. Ezért a nem kódoló fragmentumok nincsenek jelen a cDNS könyvtárakban, ellentétben egy genomi könyvtárban.

A cDNS könyvtárak fontosak a kódoló régiók, a génfunkciók, a gének expressziójának elemzéséhez stb.

2. ábra: CDNS könyvtár létrehozása

Mi a különbség a cDNS és a genomikus könyvtár között?

- diff Artikkel Közel a táblázat előtt ->

cDNS vs genomikus könyvtár

A cDNS könyvtár a komplementer DNS-t hordozó klónok gyűjteménye a szervezet mRNS-éhez

A genomikus könyvtár a klónok gyűjteménye a szervezet teljes genomiális DNS-je.
Coding vs Noncoding Sequences	cDNS könyvtár csak a kódoló szekvenciákat tartalmazza; nem tartalmaz intronokat.
A genomikus könyvtár az egész genomiális DNS-ből áll, beleértve a nem kódoló (intron és szabályozó) DNS-t.
Méret	A cDNS könyvtár kicsi.
A genomikus könyvtár nagy.
Indítóanyag	A kiindulási anyag mRNS
A kiindulási anyag a DNS.
A fordított transzkripció bevonása.	A fordított transzkripció az első cDNS-szálszintézisben történik.
A fordított átírás nem történhet meg.
Összefoglaló - cDNS és genomikus könyvtár	A genomiális könyvtár olyan klónok populációját jelenti, amelyek egy szervezet fragmentált teljes genomiális DNS-jét hordozzák. A cDNS könyvtár olyan klónok populációját jelenti, amelyek a szervezet teljes mRNS-ét komplementer DNS-t hordozzák. A cDNS klón csak az mRNS-ben található szekvenciákat tartalmazza, míg a genomi klón a teljes genom szekvenciáit tartalmazza. Ez a különbség a cDNS és a genomikus könyvtár között.

Referencia:

1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "A genomikus és a cDNS könyvtár közötti különbség. "A genomikus és a cDNS könyvtár közötti különbség. N. p., n. d. Web. Február 15.2017

2. Stekel, Dov J., Yoav Git és Francesco Falciani. "A több cDNS-könyvtárból származó génkifejezés összehasonlítása. "Genome Research. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2000. december. Web. 2016. február 16.

3.. "Genomikai könyvtár-képernyők az n-butanol toleranciában részt vevő génekben Escherichia coliban. "Genomikai könyvtár-képernyők az n-butanol toleranciában részt vevő génekben Escherichia coliban. N. p., n. d. Web. 2016. február 16.

Kép jóvoltából:

1. "CDNA könyvtár létrehozása" A PhD Dre angol Wikipédián (CC BY-SA 3. 0) Commons Wikimedia alatt

2. "Genomikus könyvtár építése" Aluquette által - Saját munkák (CC BY-SA 3. 0) Commons Wikimedia alatt